High-risk clones of ESBL-producing Klebsiella pneumoniae colonizing ICU patients in Natal, northeastern Brazil / Clones de alto risco de Klebsiella pneumoniae produtores de ESBL colonizando pacientes de UTI em Natal, Nordeste do Brasil / Clones de alto riesgo de Klebsiella pneumoniae productores de BLEE que colonizan pacientes de UCI en Natal, noreste de Brasil

Background and objectives: colonization by extended-spectrum ß-lactamase (ESBL)-producing Klebsiella pneumoniae in Intensive Care Unit (ICU) patients is considered a risk factor for infections, and poses as a source of spreading these strains in hospital facilities. This study aimed to perform the genetic characterization of ESBL-producing K. pneumoniae isolates recovered from surveillance swabs in an ICU in northeastern Brazil. Methods: the isolates were recovered between 2018-2019 from the nasal, axillary, and rectal sites of 24 patients admitted to the ICU. Bacterial identification was performed by traditional biochemical tests. Antimicrobial susceptibility was assessed by disk diffusion, and ESBL phenotype was detected by double-disc synergy test. Polymerase chain reaction (PCR) for blaCTX-M, blaSHV, and blaTEM genes, PFGE, and MLST were carried out in representative isolates. Results: a total of 27 isolates were recovered from 18 patients (75%). The ESBL production was detected in 85% of isolates. Resistance to ciprofloxacin, sulfamethoxazole/trimethoprim and most of the ß-lactams tested was recurrent, except for carbapenems. The blaSHV, blaTEM, and blaCTX-M genes were found in high frequency, and the CTX-M-(1, 2 and 9) groups were identified. Seven sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855, and ST3827) were described, most of them considered high-risk. Conclusion: these findings emphasize the potential threat of well-established high-risk clones in an ICU, and highlight the importance of monitoring these clones to prevent infections.(AU)

Justificativa e objetivos: a colonização por Klebsiella pneumoniae produtora de ß-lactamase de espectro estendido (ESBL) em pacientes de Unidade de Terapia Intensiva (UTI) é considerada um fator de risco para infecções, e representa uma fonte de disseminação dessas cepas em instalações hospitalares. Este estudo objetivou realizar a caracterização genética de isolados de K. pneumoniae produtores de ESBL recuperados de swabs de vigilância em uma UTI no Nordeste do Brasil. Métodos: os isolados foram recuperados entre 2018-2019 dos sítios nasal, axilar e retal de 24 pacientes internados na UTI. A identificação bacteriana foi realizada por testes bioquímicos tradicionais. A suscetibilidade antimicrobiana foi avaliada por disco-difusão, e o fenótipo ESBL foi detectado pelo teste de sinergia de duplo-disco. Polymerase chain reaction (PCR) para os genes blaCTX-M, blaSHV e blaTEM, PFGE e MLST foram realizados em isolados representativos. Resultados: foram recuperados 27 isolados de 18 pacientes (75%). A produção de ESBL foi detectada em 85% dos isolados. A resistência à ciprofloxacina, sulfametoxazol/trimetoprima e à maioria dos ß-lactâmicos testados foi recorrente, exceto para os carbapenêmicos. Os genes blaSHV, blaTEM e blaCTX-M foram encontrados em alta frequência, e os grupos CTX-M-(1, 2 e 9) foram identificados. Sete sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855 e ST3827) foram descritos, a maioria deles considerados de alto risco. Conclusão: esses achados enfatizam a ameaça potencial de clones de alto risco bem estabelecidos em uma UTI, e destacam a importância do monitoramento desses clones para prevenir infecções.(AU)

Justificación y objetivos: la colonización por Klebsiella pneumoniae productora de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) se considera un factor de riesgo para infecciones, y se presenta como una fuente de propagación de estas cepas en instalaciones hospitalarias. Este estudio tuvo como objetivo realizar la caracterización genética de aislamientos de K. pneumoniae productores de BLEE recuperados de hisopos de vigilancia en una UCI en el noreste de Brasil. Métodos: los aislamientos se recuperaron entre 2018-2019 de sitios nasales, axilares y rectales de 24 pacientes ingresados en la UCI. La identificación bacteriana se realizó mediante pruebas bioquímicas tradicionales. La susceptibilidad antimicrobiana se evaluó mediante difusión en disco, y el fenotipo BLEE se detectó mediante la prueba de sinergia de doble-disco. La polymerase chain reaction (PCR) para los genes blaCTX-M, blaSHV y blaTEM, PFGE y MLST se llevaron a cabo en aislamientos representativos. Resultados: se recuperaron 27 aislamientos de 18 pacientes (75%). La producción de ESBL se detectó en 85% de los aislamientos. La resistencia a ciprofloxacino, sulfametoxazol/trimetoprima y a la mayoría de los ß-lactámicos evaluados fue recurrente, excepto a los carbapenémicos. Los genes blaSHV, blaTEM y blaCTX-M se encontraron en alta frecuencia, y se identificaron los grupos CTX-M-(1, 2 y 9). Se describieron siete sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855 y ST3827), la mayoría consideradas de alto riesgo. Conclusión: estos hallazgos enfatizan la amenaza potencial de los clones de alto riesgo bien establecidos en una UCI, y resaltan la importancia de monitorear estos clones para prevenir infecciones.(AU)

Caracterización de ß-lactamasas de espectro extendido en aislamientos clínicos colombianos de Salmonella enterica no tifoidea de 1997 a 2022 / Characterization of extended spectrum ß-lactamases in Colombian clinical isolates of non-typhoidal Salmonella enterica between 1997 and 2022

Introducción. Salmonella spp. es un agente patógeno zoonótico transmitido al humano por el agua o los alimentos contaminados. La presencia de ß-lactamasas de espectro extendido es un creciente problema para la salud pública debido a que estas enzimas confieren resistencia contra las cefalosporinas de tercera y cuarta generación. Objetivo. Caracterizar las ß-lactamasas de espectro extendido en aislamientos de Salmonella spp. recibidos por el programa de vigilancia de enfermedad diarreica aguda o enfermedad transmitida por alimentos del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud. Materiales y métodos. Entre enero de 1997 y junio de 2022, se recibieron 444 aislamientos de Salmonella spp. resistentes, por lo menos, a una de las cefalosporinas de tercera generación. El fenotipo de las ß-lactamasas de espectro extendido se identificó con la prueba de doble disco. El ADN se extrajo por ebullición y mediante PCR se amplificaron los genes bla CTX-M, bla SHVy : ' a ILM. Resultados. Todos los aislamientos fueron positivos para la prueba de ß-lactamasas de espectro extendido. Los resultados de la amplificación por PCR fueron: bla CTX-M + bla TLM (n=200), bla CTX-M (n=177), bla SHV(n=16), bla SHV + bla CTX-M (n=6), bla TLM (n=13) y bla SHV + bla CTX-M + bla TLM (n=3). Del total, 26 aislamientos fueron negativos para los genes evaluados. Los aislamientos positivos para ß-lactamasas de espectro extendido se identificaron en Bogotá y en 21 departamentos: Chocó, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca. Conclusión. La resistencia a las cefalosporinas de tercera generación en aislamientos de Salmonella spp. fue generada principalmente por bla CTX-M. El 44 % (197/444) de los aislamientos presentó resistencia a ampicilina, tetraciclina, cloranfenicol y trimetoprim- sulfametoxazol Los serotipos portadores de ß-lactamasas de espectro extendido más frecuentes fueron S. Typhimurium y S. Infantis.

Introduction. Salmonella spp. is a zoonotic pathogen transmitted to humans through contaminated water or food. The presence of extended-spectrum ß-lactamases is a growing public health problem because these enzymes are resistant to third and fourth generation cephalosporins. Objective. To characterize extended-spectrum ß-lactamases in Salmonella spp. isolates received by the acute diarrheal disease/foodborne disease surveillance program of the Grupo de Microbiología of the Instituto Nacional de Salud. Materials and methods. A total of 444 Salmonella spp. isolates, resistant to at least one of the cephalosporins, were obtained between January 1997 and June 2022. The extended- spectrum ß-lactamases phenotype was identified by the double disk test. DNA extraction was carried out by the boiling method, and the bla CTX-M, bla SHV, and bla TLM genes were amplified by PCR. Results. All the isolates were positive for the extended-spectrum ß-lactamases test. The genes identified were: bla CTX-M + ba TLM (n=200), bla CTX-M (n=177), bla SHV(n=16), bla SHV + bla CTX-M (n=6), bla TLM (n=13) and bla SHV + bla CTX-M + bla TLM (n=3). Twenty-six isolates were negative for the evaluated genes. Positive extended-spectrum ß-lactamases isolates were identified in Bogotá and 21 departments: Chocó, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca. Conclusion. Resistance to third generation cephalosporins in Salmonella spp. isolates was mainly caused by bla CTX-M. Isolates were resistant to ampicillin, tetracycline, chloramphenicol, and trimethoprim-sulfamethoxazole (44 %; 197/444). The most frequent extended-spectrum ß-lactamases-expressing serotypes were Salmonella Typhimurium and Salmonella Infantis.

High levels of antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella from poultry in Ecuador / Niveles elevados de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella en aves de corral en Ecuador / Altos níveis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella de aves de criação no Equador

ABSTRACT Objective. To describe antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli and Salmonella spp. isolated from chicken carcasses and the antimicrobials commonly used in animals in Ecuador and provide information on antimicrobial resistance patterns for implementing evidence-based corrective measures. Methods. Meat samples were collected from chicken carcasses in 199 slaughterhouses across Ecuador as part of a national pilot study for monitoring antimicrobial resistance in agricultural sources in 2019. Samples were tested for E. coli and Salmonella spp. Sensitivity to 10 critically important and three highly important antimicrobials (from a human health perspective) was assessed. The country report submitted to the World Organization for Animal Health was accessed to extract the quantity of antimicrobials produced or imported for use in animals. Results. Of 383 samples, E. coli was isolated from 148 (39%) and Salmonella spp. from 20 (5%) samples. Ninety percent of the isolates were resistant to at least one critically important antimicrobial. Resistance was highest to erythromycin (E. coli 76%; Salmonella spp. 85%) and tetracycline (E. coli 71%; Salmonella spp. 90%). Critically or highly important antimicrobials (colistin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) formed the bulk (87%) of antimicrobials used in animals as per the World Organization for Animal Health report. Conclusions. High prevalence of antimicrobial resistance in poultry in Ecuador calls for the development of guidelines and regulations on the use of antimicrobials and for engagement with livestock producers. The existing surveillance system needs to be strengthened to improve the monitoring of antimicrobial use and evolving resistance patterns.

RESUMEN Objetivo. Describir los perfiles de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella spp. aisladas en carne de pollo y los antimicrobianos comúnmente empleados en animales en Ecuador, así como proporcionar información sobre los patrones de resistencia a los antimicrobianos para poner en marcha medidas correctivas basadas en la evidencia. Métodos. Se recogieron muestras de carne de pollo en 199 mataderos de todo Ecuador en el marco de un estudio piloto nacional para monitorear la resistencia a los antimicrobianos en fuentes agrícolas en el 2019. Se analizaron las muestras en busca de E. coli y Salmonella spp. Se evaluó la sensibilidad a diez antimicrobianos de importancia crítica y tres muy importantes (para la salud humana). Se accedió al informe de país presentado ante la Organización Mundial de Sanidad Animal para obtener la cantidad de antimicrobianos producidos o importados para su uso en animales. Resultados. De 383 muestras, se aisló E. coli en 148 (39%) y Salmonella spp. en 20 (5%). En total, 90% de las cepas aisladas fueron resistentes a al menos un antimicrobiano de importancia crítica. Hubo una mayor resistencia a la eritromicina (E. coli: 76%; Salmonella spp.: 85%) y a la tetraciclina (E. coli: 71%; Salmonella spp.: 90%). Los antimicrobianos de importancia crítica o muy importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprima/sulfametoxazol) constituyeron la mayor parte (87%) de los antimicrobianos empleados en animales según el informe de la Organización Mundial de Sanidad Animal. Conclusiones. Debido a la alta prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en las aves de corral en Ecuador, son imprescindibles la elaboración de directrices y regulaciones sobre el uso de antimicrobianos y el compromiso con los productores pecuarios. Es necesario fortalecer el sistema de vigilancia existente para mejorar el seguimiento del uso de antimicrobianos y de la evolución de los patrones de resistencia.

RESUMO Objetivo. Descrever perfis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella spp. isoladas de carcaças de frango e os antimicrobianos comumente usados em animais no Equador e fornecer informações sobre padrões de resistência aos antimicrobianos para implementar medidas corretivas baseadas em evidências. Métodos. Foram coletadas amostras de carne de carcaças de frango em 199 abatedouros em todo o Equador como parte de um estudo piloto nacional para monitorar a resistência aos antimicrobianos de origem agrícola em 2019. Foram testadas amostras de E. coli e Salmonella spp. Foi avaliada a sensibilidade a 10 agentes antimicrobianos de importância crítica e três agentes antimicrobianos muito importantes (do ponto de vista da saúde humana). O relatório do país apresentado à Organização Mundial de Saúde Animal foi acessado para extrair a quantidade de antimicrobianos produzidos ou importados para uso em animais. Resultados. De 383 amostras, E. coli foi isolada em 148 (39%) e Salmonella spp. em 20 (5%). Noventa por cento dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano de importância crítica. A resistência foi maior à eritromicina (E. coli, 76%; Salmonella spp., 85%) e à tetraciclina (E. coli, 71%; Salmonella spp., 90%). Antimicrobianos de importância crítica ou muito importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprim/sulfametoxazol) responderam pela maior parte (87%) dos antimicrobianos utilizados em animais, conforme o relatório da Organização Mundial de Saúde Animal. Conclusões. A alta prevalência de resistência aos antimicrobianos na avicultura no Equador exige o desenvolvimento de diretrizes e regulamentos sobre o uso de antimicrobianos e o envolvimento com os produtores de gado e avícolas. O sistema de vigilância existente precisa ser reforçado para melhorar o monitoramento do uso de antimicrobianos e a evolução dos padrões de resistência.

Risk factors for health care-associated infections by ESBL-producing germs in an intensive care unit of a public hospital in Bogotá D.C., Colombia / Factores de riesgo para infecciones asociadas a la atención en salud por gérmenes productores de BLEE en una unidad de cuidados intensivos de un hospital público en Bogotá D.C., Colombia

Abstract Introduction: Extended spectrum beta-lactamases (ESBL) produced by gram-negative bacteria have been associated with increased hospital morbidity and mortality, longer hospital stays, use of carbapenems, and higher health care costs. Few studies have assessed the risk factors for infection by ESBL-producing germs in intensive care units (ICU). Objective: To determine the risk factors for healthcare-associated infections (HAIs) by ESBL-producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli in an ICU of a public tertiary care hospital and to assess the impact of this type of infection on mortality. Materials and methods: A case-control study with a 1:2 ratio (97 cases and 194 controls) was conducted in critically ill patients admitted to the ICU of a public tertiary care hospital in Bogotá D.C. (Colombia) between January 2016 and December 2019, and in which a HAI by ESBL-producing K. pneumoniae or E. coli (cases: n=97) or K. pneumoniae or E. coli with a normal antibiotic resistance pattern (controls: n=194) was documented. Bivariate analyses were performed using the chi-squared and the Mann-Whitney U tests. A logistic regression model was used in the multivariate analysis, and a two-tailed test was performed with the p-values obtained in the bivariate analyses. Results: ESBL-producing K. pneumoniae and E. coli isolates were identified in 57 (58.76%) and 40 (41.24%) patients, respectively. These isolates were obtained mainly from urine samples (30,92%), followed by peritoneal fluid (27.80%). In the multivariate analysis, the presence of urinary tract infection on admission to the ICU was identified as a risk factor (OR=5.63, 95%CI: 1.918-16.53;; p=0.002). The mortality rate was 28.17% (26.29% in the controls and 31.95% in the cases), but no significant difference was observed between groups (p=0.311). Conclusion: Urinary tract infection on admission to the ICU was a risk factor for HAIs by ESBL-producing K. pneumoniae or E. coli. Furthermore, no significant difference was observed between cases and controls in terms of mortality.

Resumen Introducción. Las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) producidas por gérmenes gram negativos se han asociado con aumento de la morbilidad y mortalidad hospitalaria, mayor estancia hospitalaria, uso de carbapenémicos y mayores costos de atención en salud. Existen pocos trabajos que evalúen los factores de riesgo para infección por gérmenes productores de BLEE en unidades de cuidado intensivo (UCI). Objetivo. Determinar los factores de riesgo para el desarrollo de infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) por Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli productoras de BLEE en una UCI de un hospital público de tercer nivel de atención y evaluar el impacto de este tipo de infección en la mortalidad. Materiales y métodos. Estudio de casos y controles con relación 1:2 realizado en pacientes críticamente enfermos admitidos entre enero de 2016 y diciembre de 2019 a la UCI de un hospital público de tercer nivel de Bogotá D.C., Colombia, y en los que se documentó una IAAS por K. pneumoniae o E. coli productoras de BLEE (casos; n=97) y por K. pneumoniae o E. coli con fenotipo de resistencia natural (controles; n=194). Se realizaron análisis bivariados mediante las pruebas de chi-cuadrado y U de Mann-Whitney. En el análisis multivariado se usó un modelo de regresión logística, con una prueba de dos colas con los valores p obtenidos en los análisis bivariados. Resultados. Se identificaron aislamientos de K. pneumoniae y de E. coli productoras de BLEE en 57 (58,76%) y 40 (41,24%) de los casos, respectivamente y estos aislamientos se obtuvieron principalmente de muestras de orina (30.92%), seguido de líquido peritoneal (27.83%). En el análisis multivariado, la presencia de infección de vías urinarias al ingreso a UCI fue identificada como factor de riesgo (OR=5.63, IC95%:1.918-16.527; p=0,002). La tasa de mortalidad fue del 28.17% (26.29% en los controles y 31.95% en los casos), pero no se observó una diferencia significativa entre grupos (p=0.311). Conclusión. La infección de vías urinarias al ingreso a la UCI fue un factor de riesgo para la IAAS por K. pneumoniae o E. coli productoras de BLEE. Además, no se observó una diferencia significativa entre los casos y controles en términos de mortalidad.

Resistencia antibiótica de Escherichia coli, según producción de beta lactamasas de espectro extendido, en urocultivos. Hospital III-1. Chiclayo, Perú 2020

Objetivo: determinar la resistencia antibiótica de Echerichia coli, en urocultivos, según produccion de BLEE, en pacientes hospitalizados. El estudio: Diseño descriptivo - retrospectivo. La identificación bacteriana se hizo con VITEK XL, la susceptibilidad, con las pautas del CLSI M100. 30 edicion. Hallazgos. E. coli BLEE positivo, presento resistencia de 0% a: Meropenem, ertapenem, tigeciclina y colistina. Piperacilina/tazobactam, nitrofurantoina, imipenem, amicacina con 16.7%, 6.2%, 5% y 1% respectivamente. E. Coli BLEE negativo, presento resistencia de 0% a: cefotaxima, cefuroxime, tigeciclina y piperacilina/tazobactam. Ceftriaxona, cefepime, gentamicina, cefazolina, ceftazidima, nitrofurantoina, meropenem, amicacina, imipenem y ertapenem con 14.7%, 13%, 13%, 10.7%, 9.7%, 9.1%, 9.1%, 8%, 5%, 2.7%, respectivamente. Conclusion: Meropenen, ertapenem, tigeciclina, colestina, piperacilina/tazobactam, nitrofurantoina, amicacina y imipenem, con resistencia menor de 20%, fueron los mismos, para E. coli BLEE positivo, y E. coli, sin considerar la produccion de BLEE.

ABSTRAC Objective: to determine the antibiotic resistance of Echerichia coli, in urine cultures, according to ESBL production, in hospitalized patients. The study: Descriptive-retrospective design. Bacterial identification was done with VITEK XL, susceptibility, with the CLSI M100 guidelines. 30 edition. Findings: E. coli ESBL positive, presented 0% resistance to: Meropenem, ertapenem, tigecycline and colistin. Piperacillin/tazobactam, nitrofurantoin, imipenem, amikacin with 16.7%, 6.2%, 5% and 1% respectively. E. Coli ESBL negative, presented 0% resistance to: cefotaxime, cefuroxime, tigecycline and piperacillin/tazobactam. Ceftriaxone, cefepime, gentamicin, cefazolin, ceftazidime, nitrofurantoin, meropenem, amikacin, imipenem, and ertapenem with 14.7%, 13%, 13%, 10.7%, 9.7%, 9.1%, 9.1%, 8%, 5%, 2.7%, respectively. Conclusion: Meropenen, ertapenem, tigecycline, cholesterol, piperacillin/tazobactam, nitrofurantoin, amikacin and imipenem, with less than 20% resistance, were the same for ESBL-positive E. coli, and E. coli, without considering ESBL production.

Impacto de infecciones y enterobacterias productoras de betalactamasa de espectro extendido en la supervivencia del injerto y del paciente en un programa de trasplante renal en México / Impact of infections and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae on graft and patient survival in a kidney transplantation program in Mexico

Resumen Introducción: Los tratamientos inmunosupresores han mejorado las tasas de supervivencia del injerto y del paciente, pero pueden incrementar las infecciones postrasplante. Objetivos: Analizar los datos de pacientes con trasplante renal y describir las bacterias responsables de las infecciones que presentan. Métodos: Estudio observacional, longitudinal y analítico de 103 pacientes sometidos a trasplante renal. El periodo de seguimiento fue de 5.07 ± 1.28 años. Resultados: La tasa de mortalidad fue de 10.68 % y la de pérdida del injerto de 14.56 %. Respecto al riesgo de muerte del receptor, el modelo de regresión de Cox mostró un cociente de riesgo (HR, hazard ratio) de 5.66 en los pacientes con cultivo bacteriano positivo y de 2.22 en aquellos con cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE); en cuanto a la pérdida del injerto, el HR fue de 4.59 en quienes tuvieron cultivo bacteriano positivo y de 4.25 en aquellos con cepas productoras de BLEE. Conclusiones: Se encontró riesgo significativo de muerte en receptores de trasplante renal con cultivo bacteriano positivo y mayor riesgo de pérdida del injerto en aquellos con cultivo bacteriano positivo y aislamiento de cepas productoras de BLEE. La tasa de enterobacterias productoras de BLEE es alta, por ello son necesarias estrategias más estrictas para controlar del uso de antibióticos.

Abstract Introduction: Immunosuppressive treatments have improved graft and patient survival rates, but can increase the incidence of post-transplant infections. Objectives: To analyze data from kidney transplant patients and describe the pathogens responsible for the infections they experience. Methods: Longitudinal, analytical, observational study of 103 patients who underwent kidney transplantation. The follow-up period was 5.07 ± 1.28 years. Results: Overall mortality rate was 10.68% and graft loss rate was 14.56%. Regarding recipient risk of death, the Cox regression model showed a hazard ratio (HR) of 5.66 for positive bacterial cultures and 2.22 for positive extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strains; as for graft loss, HR was 4.59 in those with positive bacterial cultures and 4.25 in those who were positive for ESBL-producing strains Conclusions: Significant death risk was found in kidney transplant recipients with positive bacterial cultures and an increased risk of graft loss in those with positive bacterial cultures and in those who were positive for ESBL-producing Enterobacteriaceae isolates. The rate of ESBL-producing Enterobacteriaceae is high, and stricter strategies are therefore necessary to control the use of antibiotics.

Identificación de enterobacterias multirresistentes a antibióticos en muestras de heces de lactantes residentes en Talara, Piura, Perú / Identification of multidrug-resistant enterobacteriaceae in fecal samples from infants residing in Talara, Piura, Peru Arturo

La colonización fecal en lactantes por bacterias resistentes a los antimicrobianos es un potencial riesgo para futuras terapias antibióticas. Nuestro objetivo fue determinar la frecuencia y características sociodemográficas de lactantes portadores fecales de enterobacterias resistentes a ciprofloxacina (PFRC) y sus genes de resistencia asociados. Analizamos muestras fecales de 41 niños lactantes residentes en el distrito de Talara-Piura, Perú, en 2019. Evaluamos la presencia de 3 genes de resistencia a quinolonas: aac(6')-Ib-cr, qnrB y oqxA y 2 de betalactamasas: bla CTX-M, bla PER-2.El 68% de lactantes fueron PFRC, Escherichia coli (83,3%) fue el más frecuente. El análisis genotípico detectó: oqxA (41,1%), qnrB (26,7%) y aac(6')-Ib-cr (20%) y al gen bla CTX-M en el 93,3% de los aislados con betalactamasas. La elevada frecuencia de PFRC nos alertan sobre el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica en el área de estudio.

Fecal colonization by antimicrobial-resistant bacteria in infants is a potential risk for future antibiotic therapy. We aimed to determine the sociodemographic characteristics and frequency of infants who were fecal carriers of ciprofloxacin-resistant enterobacteriaceae (FCCRE) and their associated resistance genes. We analyzed fecal samples from 41 infants from the district of Talara, Piura, Peru in 2019. The presence of 3 quinolone resistance genes was evaluated: aac(6')-Ib-cr, qnrB and oqxA as well as of 2 beta-lactamase genes: bla CTX-M,bla PER-2. We found that 68% of infants were FCCRE, Escherichia coli (83.3%) was the most frequent bacteria. The genotypic analysis detected: oqxA (41.1%), qnrB (26.7%), aac(6')-Ib-cr (20%) and the bla CTX-M gene (93.3%) of the isolates with beta-lactamases. The high frequency of FCCRE alerts us of the potential risk of this antibiotic family becoming less useful over time.

Factores asociados a la colonización rectal por Enterobacteriaceae productoras de betalactamasas de espectro extendido en pacientes de consulta externa de un hospital al norte del Perú / Factors associated with rectal colonization by extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in outpatients in a hospital in northern Peru

Introducción: Las Enterobacteriaceae productoras de betalactamasas de espectro extendido están presentes en las heces de los individuos de la comunidad. En Perú, la automedicación, el tipo de alimentación, condiciones sanitarias podrían asociarse a esta colonización. Objetivo: determinar la frecuencia de colonización rectal por EP-BLEE en pacientes de consulta externa del Hospital Regional Lambayeque, así como los factores asociados a la misma, durante los meses de julio 2018 a febrero 2019. Material y métodos: 331 pacientes participantes fueron entrevistados, de los cuales se obtuvieron tres muestras seriadas de heces recién emitidas. Las muestras fueron cultivadas en agar McConkey. Las EP-BLEE se confirmaron con la prueba de disco combinado (método americano). Resultados: el 85,8 % de los pacientes estuvieron colonizados por EP-BLEE, siendo Escherichia coli el aislamiento más frecuente (87,7 %). El análisis bivariado asoció el consumo de carne de cerdo (RP=1,15 IC 95%: 1,07 - 1,24), caprino (RP=1,18, IC 95%: 1,10 - 1,25) y el consumo de ensaladas frecuentemente (RP=1,15, IC 95 %: 1,05 - 1,28) con una mayor probabilidad de ser portador rectal de EP-BLEE. La automedicación presentó valores cercanos al límite de validez (p=0,051, RP 1,12, IC 95% 0,98 - 1,26). Conclusiones: Consumir carne de cerdo, caprino y ensaladas aumentan la probabilidad de ser portador de EP-BLEE, mientras que la automedicación podría estar asociada, por lo que es necesario seguir investigando, ya que se desconocen las razones de este hallazgo en pacientes de la comunidad.

Background:Extended-spectrumbeta-lactamase-producing Enterobacteriaceae(EP-BLEE) are present in the feces of individuals in the community. In Peru, self-medication, type of diet and sanitary conditions could be associated with this colonization. Objective:to determine the frequency of rectal colonization by EP-BLEE in outpatients of the "Hospital Regional Lambayeque", as well as the factors associated with it, during the months of July 2018 to February 2019. 331 participating patients Material and methods:were interviewed, and three serial samples of freshly emitted stool were obtained from them. The samples were cultured on McConkey agar. EP-BLEE were confirmed with the combined disc test (American method). 85.8% of patients were colonized by EP-BLEE, and Escherichia coliwas the most frequent isolate (87.7%). Bivariate Results:analysis associated the consumption of pork (RP=1.15, 95% CI: 1.07 - 1.24), goat (RP=1.18, 95% CI: 1.10 - 1.25) and frequent consumption of salads (RP=1.15, 95% CI: 1.05 - 1.28) with a higher probability of being a rectal carrier of EP-BLEE. Self-medication presented values close to the limit of validity (p=0.051, RP1.12, 95% CI 0.98 - 1.26). Consuming pork, goat meat and salads increase the probability Conclusions:of being a carrier of EP-BLEE, while self-medication could be associated, so further research is needed, since the reasons for this finding are unknown.

Escherichia coli productora de BLEE de origen comunitario e intrahospitalario / BLEE-producing Escherichia coli of community and hospital-acquired origin / Escherichia coli produtora de BLEE de origem comunitária e hospitalar

Escherichia coli (E. coli) constituye una de las principales enterobacterias patógenas causantes de infecciones asociadas a la asistencia en salud, con alto impacto a nivel hospitalario y comunitario por su elevada tasa de morbilidad y mortalidad. El mecanismo de defensa de estas bacterias es mediante la generación de enzimas de resistencia, como la producción de Beta-lactamasas de espectro extendido. OBJETIVO: caracterizar la resistencia a betalactámicos de espectro extendido a partir de su prevalencia en aislados de Escherichia coli de origen comunitario e intrahospitalario de la ciudad de Azogues. MATERIALES Y MÉTODOS: estudio de tipo descriptivo, documental. La población estuvo conformada por 877 registros de la base de datos WHONET de aislados de E. coli procedentes de muestras de origen comunitario e intrahospitalario del laboratorio del Hospital Homero Castanier Crespo. RESULTADOS: el 75,5% de los aislados fueron de mujeres y el 24,5 % de varones. La media de edad fue 43,5 años. La frecuencia de E. coli productora de BLEE fue del 17,7 % con mayor frecuencia en varones (23,7%), en el área de clínica (25,2%), cirugía (16,8%) y en muestras de herida quirúrgica (11,6%). Predominó la resistencia a betalactámicos (84,5%) y cefalosporinas de primera y segunda generación mayor al 48%. Los carbapenemes (imipenen 97,3% y meropenem 96,7%), aminoglucósidos (amikacina 94,9 y gentamicina 80,5), fosfomicina (90,3) y nitrofurantoina (96,7%) mostraron mayor sensibilidad. CONCLUSIONES: la monitorización constante de enzimas BLEE, permite la detección temprana de patrones de sensibilidad y a la vez orienta a un tratamiento terapéutico adecuado, evitando generación de nuevas resistencias y altas tasas de morbilidad y mortalidad.

Escherichia coli (E. coli) is one of the main pathogenic enterobacteria causing infections associated with health care, with high impact at hospital and community level due to its high morbidity and mortality rate. The defense mechanism of these bacteria is through the generation of resistance enzymes, such as the production of extended spectrum beta-lactamases. OBJECTIVE: to characterize extended-spectrum beta-lactam resistance based on its prevalence in Escherichia coli isolates of community and intrahospital origin in the city of Azogues. MATERIALS AND METHODS: descriptive, documentary study. The population consisted of 877 records from the WHONET database of E. coli isolates from community and in-hospital samples from the Homero Castanier Crespo Hospital laboratory. RESULTS: 75.5% of the isolates were from females and 24.5% from males. The mean age was 43.5 years. The frequency of BLEE-producing E. coli was 17.7%, with a higher frequency in males (23.7%), in the clinical area (25.2%), surgery (16.8%) and in surgical wound samples (11.6%). Resistance to beta-lactams predominated (84.5%) and first and second generation cephalosporins was greater than 48%. Carbapenems (imipenem 97.3% and meropenem 96.7%), aminoglycosides (amikacin 94.9 and gentamicin 80.5), fosfomycin (90.3) and nitrofurantoin (96.7%) showed higher sensitivity. CONCLUSIONS: the constant monitoring of BLEE enzymes allows the early detection of sensitivity patterns and at the same time guides to an adequate therapeutic treatment, avoiding the generation of new resistances and high morbidity and mortality rates.

A Escherichia coli (E.coli) é uma das principais enterobactérias patogênicas que causam infecções associadas aos cuidados de saúde, com alto impacto em nível hospitalar e comunitário devido a sua alta taxa de morbidade e mortalidade. O mecanismo de defesa dessas bactérias é através da geração de enzimas de resistência, tais como a produção de beta-lactamases de espectro estendido. OBJETIVO: caracterizar a resistência beta-lactam de amplo espectro com base em sua prevalência em Escherichia coli isolados de origem comunitária e intra-hospitalar na cidade de Azogues. MATERIAIS E MÉTODOS: estudo descritivo, documental. A população consistia de 877 registros do banco de dados WHONET de E. coli isolados de amostras comunitárias e hospitalares do laboratório do Hospital Homero Castanier Crespo. RESULTADOS: 75,5% dos isolados eram de fêmeas e 24,5% de machos. A idade média era de 43,5 anos. A freqüência da E. coli produtora de BLEE foi de 17,7%, com maior freqüência em homens (23,7%), na área clínica (25,2%), na cirurgia (16,8%) e em amostras de feridas cirúrgicas (11,6%). A resistência aos beta-lactâmicos (84,5%) e às cefalosporinas de primeira e segunda geração predominou (mais de 48%). Carbapenems (imipenem 97,3% e meropenem 96,7%), aminoglicosídeos (amikacin 94,9 e gentamicina 80,5), fosfomicina (90,3) e nitrofurantoína (96,7%) mostraram maior sensibilidade. CONCLUSÕES: o monitoramento constante das enzimas BLEE permite a detecção precoce de padrões de sensibilidade e, ao mesmo tempo, orienta para um tratamento terapêutico adequado, evitando a geração de novas resistências e altas taxas de morbidade e mortalidade.

Mecanismos de resistencia en aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae

Resumen La bacteria Klebsiella pneumoniae es la causante de infecciones intrahospitalarias multirresistentes, posee diversos mecanismos de resistencia como la producción de enzimas betalactamasas cuya acción afecta a los antibióticos betalactámicos. Objetivo: Caracterizar los mecanismos de resistencia presentes en aislados clínicos con Klebsiella pneumoniae identificados mediante métodos fenotípicos en el Hospital Monte Sinai desde enero de 2018 hasta agosto de 2020. Materiales y métodos: Estudio positivista con un enfoque cuantitativo de corte transversal descriptivo de diseño documental. La población estuvo conformada por 274 datos de aislados clínicos identificados con Klebsiella pneumoniae. Los cuales conformaron la totalidad de la muestra con un muestreo por cobertura total. Mismos que fueron recopilados de fuentes secundarias ingresados en la base de datos del departamento de Microbiología. Para el análisis se utilizó estadística descriptiva. Resultados: Klebsiella pneumoniae mostró mayor frecuencia en el año 2020 con el 35%. Se identificó al mecanismo de resistencia BLEE con el 27,7% y carbapenemasas tipo KPC con el 7.7 %, con mayor presencia en el sexo masculino. Presentó una mayor resistencia a Penicilinas, una sensibilidad moderada a Cefalosporinas, Aminoglucósidos, Quinolonas y una alta sensibilidad a los Carbapenémicos, Tigeciclina y Colistina. Los aislados se clasificaron como multidrogorresistentes, con mayor frecuencia en Urocultivo, Aspirado bronquial, Líquido corporal, Punta de Catéter y Hemocultivo en áreas de Hospitalización, UCI y Neonatología. Conclusiones: Los mecanismos de resistencia de K. pneumoniae a los antibióticos son un hallazgo común en ambientes hospitalarios independientemente de sexo, servicio hospitalario o tipo de muestra, convirtiéndose en un problema de salud pública.

Abstract The bacterium Klebsiella pneumoniae is the cause of multiresistant intrahospital infections, it has various resistance mechanisms such as the production of beta-lactamase enzymes whose action affects beta-lactam antibiotics. Objective: To characterize the resistance mechanisms present in clinical isolates with Klebsiella pneumoniae identified by phenotypic methods at Monte Sinai Hospital from January 2018 to August 2020. Materials and methods: Positivist study with a descriptive cross-sectional quantitative approach to documentary design. The population consisted of 274 data from clinical isolates identified with Klebsiella pneumoniae. Which made up the entire sample with a total coverage sampling. The same ones that were collected from secondary sources entered in the database of the Microbiology department. Descriptive statistics were used for the analysis. Results: Klebsiella pneumoniae showed a higher frequency in 2020 with 35%. The ESBL resistance mechanism was identified with 27.7% and KPC-type carbapenemases with 7.7%, with a higher presence in males. It presented a greater resistance to Penicillins, a moderate sensitivity to Cephalosporins, Aminoglycosides, Quinolones and a high sensitivity to Carbapenems, Tigecycline and Colistin. The isolates were classified as multidrug resistant, more frequently in Urine culture, Bronchial aspirate, Body fluid, Catheter Tip and Blood culture in Hospitalization, ICU and Neonatology areas. Conclusions: The resistance mechanisms of K. pneumoniae to antibiotics are a common finding in hospital settings regardless of sex, hospital service or type of sample, becoming a public health problem.

Resumo A bactéria Klebsiella pneumoniae é causa de infecções intra-hospitalares multirresistentes, possui diversos mecanismos de resistência como a produção de enzimas beta-lactamase cuja ação afeta os antibióticos beta-lactâmicos. Objetivo: Caracterizar os mecanismos de resistência presentes em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae identificados por métodos fenotípicos no Hospital Monte Sinai de janeiro de 2018 a agosto de 2020. Materiais e métodos: Estudo positivista com abordagem quantitativa transversal descritiva do design documental. A população consistia em 274 dados de isolados clínicos identificados com Klebsiella pneumoniae. O que constituiu toda a amostra com uma amostra de cobertura total. Os mesmos que foram coletados em fontes secundárias e cadastrados no banco de dados do departamento de Microbiologia. Estatísticas descritivas foram utilizadas para a análise. Resultados: Klebsiella pneumoniae apresentou maior frequência em 2020 com 35%. O mecanismo de resistência a ESBL foi identificado com 27,7% e carbapenemases do tipo KPC com 7,7%, com maior presença no sexo masculino. Apresentou maior resistência às Penicilinas, sensibilidade moderada às Cefalosporinas, Aminoglicosídeos, Quinolonas e alta sensibilidade aos Carbapenêmicos, Tigeciclina e Colistina. Os isolados foram classificados como multirresistentes, com maior frequência em Urocultura, Aspirado Brônquico, Fluido Corporal, Ponta de Cateter e Hemocultura em Hospitalização, UTI e Neonatologia. Conclusões: Os mecanismos de resistência de K. pneumoniae aos antibióticos são um achado comum em ambientes hospitalares independentemente do sexo, serviço hospitalar ou tipo de amostra, tornando-se um problema de saúde pública.

Staphylococcus aureus resistentes a meticilina en alimentos

Resumen Staphylococcus aureus es un microorganismo de importancia tanto a nivel hospitalario como en la comunidad; considerado parte de la microbiota normal en los humanos cuando existe condiciones apropiadas se comporta como oportunista, provoca infecciones leves hasta complicadas. Existen cepas de S. aureus multirresistentes a los antibióticos, debido a la adquisición por vía horizontal de genes de resistencia; entre ellas Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (SARM), agentes etiológicos de infecciones graves relacionados directamente al consumo de alimentos contaminados. Objetivo. Analizar los posibles riesgos a los que se expone el ser humano al consumir alimentos contaminados por SARM, además de identificar los alimentos con mayor riesgo de contaminación y los factores que llevan a esta condición. Metodología. Mediante una revisión sistemática de estudios que indican la presencia de SARM en alimentos reportados en América latina. Las bases de datos consultadas: PubMed, SCOPUS, SCIELO y ProQuest mediante la declaración PRISMA. Se detectaron 30 estudios siendo elegibles 12. Resultados. En América Latina se observó en Brasil mayor evidencia de SARM, luego Colombia y Chile; en los estudios encontrados indican que los alimentos con frecuencia mayor de contaminación de alimentos son los lácteos y sus derivados; productos cárnicos. Conclusiones. Se evidencia la estrecha relación entre el agente causal de contaminación que es SARM en alimentos a nivel de América Latina. El producto que más impacto ha presentado es la leche y sus derivados, los cuales al ser productos muy consumibles la salud de la población está en riesgo por la acción de enterotoxinas.

Abstract Staphylococcus aureus is an important microorganism both at hospital and community level; considered part of the normal microbiota in humans when appropriate conditions exist, it behaves as an opportunist, causing mild to complicated infections. There are strains of S. aureus multiresistant to antibiotics, due to the horizontal acquisition of resistance genes, including methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), etiological agents of serious infections directly related to the consumption of contaminated food. Objective. To analyze the possible risks to which humans are exposed when consuming food contaminated by MRSA, in addition to identifying the foods with the highest risk of contamination and the factors that lead to this condition. Methodology. Through a systematic review of studies indicating the presence of MRSA in food reported in Latin America. Databases consulted: PubMed, SCOPUS, SCIELO and ProQuest through the PRISMA statement. Thirty studies were detected and 12 were eligible. Results. In Latin America, the greatest evidence of MRSA was observed in Brazil, followed by Colombia and Chile; the studies found indicate that the foods with the highest frequency of food contamination are dairy products and their derivatives; meat products. Conclusions. There is evidence of a close relationship between the causal agent of MRSA contamination in food in Latin America. The product that has had the greatest impact is milk and its derivatives, which, being highly consumable products, put the health of the population at risk due to the action of enterotoxins.

Resumo Staphylococcus aureus é um microorganismo importante tanto a nível hospitalar como comunitário; considerado parte da microbiota normal em humanos quando existem condições apropriadas, comporta-se como oportunista, causando infecções leves a complicadas. Existem estirpes de S. aureus multiresistentes aos antibióticos, devido à aquisição horizontal de genes de resistência, incluindo Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA), agentes etiológicos de infecções graves directamente relacionadas com o consumo de alimentos contaminados. Objectivo. Analisar os possíveis riscos a que os seres humanos estão expostos ao consumir alimentos contaminados por MRSA, para além de identificar os alimentos com maior risco de contaminação e os factores que levam a esta condição. Metodologia. Através de uma revisão sistemática de estudos que indicam a presença de MRSA nos alimentos reportados na América Latina. Bases de dados consultadas: PubMed, SCOPUS, SCIELO e ProQuest, utilizando a declaração PRISMA. Foram detectados trinta estudos, 12 dos quais eram elegíveis. Resultados. Na América Latina, a maior evidência de MRSA foi observada no Brasil, seguido pela Colômbia e Chile; os estudos encontrados indicam que os alimentos com maior frequência de contaminação de alimentos são produtos lácteos e seus derivados; produtos de carne. Conclusões. Há provas de uma relação estreita entre o agente causal da contaminação por MRSA nos alimentos na América Latina. O produto que tem tido maior impacto é o leite e seus derivados, que como são produtos altamente consumíveis, a saúde da população está em risco devido à acção das enterotoxinas.

Multirresistencia en Escherichia coliasociada a Betalactamasas de Espectro Extendido en urocultivos obtenidos en pacientes de una provincia de la Amazonía Peruana / Multiresistance in Escherichia coli associated with Extended Spectrum Beta-lactamases in urine cultures obtained in patients from a province of the Peruvian Amazon

Introducción: Los antibióticos betalactámicos son los más utilizados en el tratamiento de las infecciones urinarias en el Perú. La resistencia bacteriana se produce frecuentemente por la presencia de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE) en enterobacterias. Objetivo: Determinar la multirresistencia en E. coli asociada a betalactamasas de espectro extendido en urocultivos de adultos que residen en la provincia de Tambopata-Madre De Dios. El estudio: Estudio no experimental, descriptivo, la detección y la confirmación de BLEE se realizó con la técnica de doble disco usando ceftazidima, cefotaxima, cefepime, aztreonam y amoxicilina más ácido clavulánico. La resistencia y susceptibilidad microbiana se identificó usando la técnica de disco de difusión. Hallazgos: Se aislaron 162 cepas de E. coli. Se identificaron cepas con resistencia a los antibióticos ampicilina (71%), trimetoprim sulfametoxazol (49%), ácido ciprofloxacino (37%), ácido nalidíxico (37%) y aztreonam (31%). Conclusión: Existe resistencia antimicrobiana mediada por cepas de E. coli productoras BLEE.

Background:Beta-lactamantibioticsarethemostusedinthe treatment of urinary infections in Peru. Bacterial resistance is frequently produced by the presence of Extended Spectrum Betalactamases (ESBL) in Enterobacteriaceae. To determine the multi-resistance inObjective:E. coliassociated to extended spectrum beta-lactamases in urine cultures from adults residing in the province of Tambopata-Madre De Dios. The study:Non-experimental, descriptive study, detection and confirmation of ESBLwas performed with the double disc technique using ceftazidime, cefotaxime, cefepime, aztreonam and amoxicillin plus clavulanic acid. Microbial resistance and susceptibility was identified using the diffusion disk technique. 162 strains of E. coliwere isolated. Strains Findings:withresistancetotheantibioticsampicillin(71%),trimethoprine sulfamethoxazole (49%), ciprofloxacin acid (37%), nalidixic acid (37%) andaztreonam(31%)wereidentified.Thereis Conclusion:antimicrobial resistance mediated by ESBL-producing strains of E. coli.

Perfil de resistencia genotípica y fenotípica presente en bacterias aisladas a partir de fómites en Armenia, Quindío-Colombia período junio-julio 2019 / Genotypic and phenotypic resistance profile present in bacteria isolated from fomites in Armenia, Quindío-Colombia period June-July 2019

Resumen Introducción: La antibiótico-resistencia es un fenómeno por el cual las bacterias logran sobrevivir al tratamiento con antimicrobianos; con incidencia en ambientes intra y extrahospitalarios como: fuentes hídricas, sector agrario/ganadero y fómites. Objetivo: Describir bacterias presentes en fómites de alta circulación en una región centro-occidental de Colombia junto a su perfil de sensibilidad fenotípica y presencia de genes para betalactamasas tipo TEM-full, OXA-3 y SHV-full. Metodología: Se aislaron cepas bacterianas de billetes, pasamanos de escaleras eléctricas y botones de cajeros automáticos; se evaluó su perfil de sensibilidad fenotípica por medio de concentración mínima inhibitoria-técnica automatizada/Vitek2® y genes para betalactamasas tipo TEM-full, OXA-3 y SHV-full mediante PCR convencional. Resultados: Se obtuvo 30 aislados; Acinetobacter baumannii complex, fue la más común; el fómite con mayor aislados y resistencia fueron los billetes; el 53% portó al menos uno de los genes estudiados. Se identificaron bacterias gramnegativas con resistencia frente a: Imipinem, Piperacilina/Tazobactam, Colistina, Ceftazidima, Tigeciclina y Ceftriaxona; bacterias grampositivas con resistencia frente a: Quinupristina/Dalfopristina, Minociclina, Tetraciclina, Teicoplanina, Nitrofuratoina, Oxacilina, Clindamicina, Trimetropina-sulfametoxazol, y Minociclina. Conclusión: Teniendo en cuenta la circulación de cepas con estas resistencias, es importante la educación en la comunidad para evitar la adquisición o propagación de infecciones por manipulación inadecuada de fómites.

Abstract Introduction: Antibiotic-resistance is a phenomenon by which bacteria manage to survive antimicrobial treatment; with incidence in intra and extra hospital environments such as: water sources, agricultural / livestock sector and fomites. Aim: To describe bacteria present in high circulation fomites in a central-western region of Colombia, with their phenotypic sensitivity profile and presence of genes beta-lactamases (TEM, OXA3 and SHV). Methodology: We isolate bacterial strains from banknotes, escalator handrails and ATM buttons. We evaluated its phenotypic sensitivity profile by minimal inhibitory concentration automated technique using Vitek 2® and presence of genes for beta-lactamases type TEM-full, OXA-3 and SHV-full by conventional PCR. Results: A total of 30 isolates were obtained; Acinetobacter baumannii complex, was the most common; banknotes were the form with the highest number of isolates and resistance. Of the total isolates, 53% carried at least one of the genes studied. Phenotypically, gram-negative bacteria were identified with resistance against: Imipinem, Piperacillin / Tazobactam, Colistin, Ceftazidime, Tigecycline and Ceftriaxone; Gram-positive bacteria with resistance to: Quinupristin / Dalfopristin, Minocycline, Tetracycline, Teicoplanin, Nitrofuratoin, Oxacillin, Clindamycin, Trimethropine-sulfamethoxazole, and Minocycline. Conclusion: Taking into account the circulation of strains with these resistances, it is important to educate the community to avoid the acquisition or spread of infections due to the inappropriate handling of this type of inanimate elements.

Caracterización de Escherichia coli D7111 productora de ß-LACTAMASA TEM-176 / Characterization of Escherichia coli D7111 producing the ß-LACTAMASA TEM-176

RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.

ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.

Caracterización de Escherichia coli D7111 productora de ß-LACTAMASA TEM-176 / Characterization of Escherichia coli D7111 producing the ß-LACTAMASE TEM-176

RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.

ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.

Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido en un hospital de La Habana

RESUMEN Introducción: En microorganismos gramnegativos la producción de enzimas betalactamasas es el mecanismo más común de resistencia. Las de espectro extendido constituyen un grupo importante por su capacidad de inactivar las cefalosporinas de tercera y cuarta generación y el aztreonam. Su detección es vital para indicar el tratamiento óptimo y las medidas de aislamiento que eviten la dispersión de los microorganismos que las portan. Objetivos: Determinar la incidencia y principales características de los aislados de Escherichiacoli y Klebsiellapneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en muestras no urogenitales. Métodos: Estudio transversal realizado en el hospital "Salvador Allende" durante el año 2017. Se determinó la frecuencia de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido, su procedencia según servicio del hospital, tipo de muestra clínica, y su sensibilidad antimicrobiana. La identificación de betalactamasas de espectro extendido se hizo por el método de doble disco de Jarlier. Resultados: Fueron productores de betalactamasas de espectro extendido 46 y 50 % de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae, respectivamente. La mayoría provenían de muestras de las salas del Instituto de Angiología, el antimicrobiano con mayor efectividad fue el meropenem, la sensibilidad al resto de los antimicrobianos estuvo por debajo de 80 % y no hubo aislados sensibles a las cefalosporinas de tercera generación. Conclusiones: Se demuestra una alta incidencia de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en el Hospital "Salvador Allende" de La Habana, más marcada en las salas del Instituto de Angiología y en muestras de piel.

ABSTRACT Introduction: Beta-lactamase production is the most common resistance mechanism in gram-negative microorganisms. Extended-spectrum beta-lactamases are an important group of enzymes capable of inactivating third- and fourth-generation cephalosporins and aztreonam. Their detection is important to indicate the optimum treatment as well as isolation measures aimed at preventing the spread of carrier microorganisms. Objectives: Determine the incidence and main characteristics of isolates of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from non-urogenital samples. Methods: A cross-sectional study was conducted at Salvador Allende hospital during the year 2017. Determination was made of the frequency of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, their origin by hospital service, the type of clinical sample and their antimicrobial sensitivity. Identification of extended-spectrum beta-lactamases was based on the Jarlier double disc method. Results: Of the total Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates studied, 46% and 50%, respectively, were extended-spectrum beta-lactamase producers. Most had been obtained from samples taken in wards of the Institute of Angiology; the most effective antimicrobial was meropenem; sensitivity to the remaining antimicrobials was below 80%; no isolates were sensitive to third-generation cephalosporins. Conclusions: A high incidence was found of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates at Salvador Allende Hospital in Havana, more noticeably in Institute of Angiology wards and skin samples.

Factores de riesgo para infección del tracto urinario por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños en Huancayo, Perú

Introducción: La infección del tracto urinario en los niños es una de las infecciones bacterianas más frecuentes con una alta tasa de recurrencia. Objetivo: Determinar los factores de riesgo para infección del tracto urinario adquirida en la comunidad por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños en Huancayo, Perú. Métodos: Estudio de tipo analítico con diseño de casos y controles. Se estudiaron 220 niños entre el mes de nacido hasta 13 años de edad, ingresados en el hospital nacional "Ramiro Priale Priale" con el diagnóstico de infección del tracto urinario durante el año 2019. Se distribuyeron en dos grupos (40 casos y 80 controles). Para cada paciente se llenó un cuestionario con las variables de interés y se realizó la comparación entre los grupos. Se realizó el análisis multivariado considerando significativo un valor de p< 0,05. Resultados: La frecuencia de infección del tracto urinario causada por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido es de 18,18 %. En los casos la edad predominante está entre 1 y 3 años con 42,5 %, sexo femenino con 62,5 %, la bacteria predominante es: Escherichia coli en 85,0 %. Durante el análisis multivariado la presencia de infección del tracto urinario complicada tuvo OR 18,62 y p= 0,000 y la recurrente OR 12,98 y p= 0,004, ambas estadísticamente significativas para el desenlace de esta infección en los niños. Conclusión: Los factores de riesgo para infección del tracto urinario adquirida en la comunidad por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños son: infección del tracto urinario complicada y la recurrente.

Introduction: Urinary tract infection in children is one of the most frequent bacterial infections with a high rate of recurrence. Objective: Determine the risk factors for community-acquired urinary tract infection by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases in children of Huancayo, Peru. Methods: Analytical study with case-control design. 220 children from one month to 13 years of age were studied, whom were admitted to "Ramiro Priale Priale" National Hospital with the diagnosis of urinary tract infection during the year 2019. They were distributed in two groups (40 cases and 80 controls). For each patient, a questionnaire was completed with the variables of interest, and the comparison between the groups was made. The multivariate analysis was performed considering significant a value of p< 0.05. Results: The frequency of urinary tract infection caused by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases is 18.18%. In the cases, the predominant age is between 1 and 3 years with 42.5%, female sex with 62.5%, the predominant bacterium is: Escherichia coli in 85.0%. During the multivariate analysis, the presence of complicated urinary tract infection had OR 18.62 and p= 0.000 and recurrent OR 12.98 and p= 0.004, both statistically significant for the outcome of this infection in children. Conclusion: The risk factors for community-acquired urinary tract infection by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases in children are complicated and recurrent urinary tract infections.

Escherichia coli extraintestinal, resistencia antimicrobiana y producción de betalactamasas en aislados cubanos / Extraintestinal Escherichia coli, antimicrobial resistance and betalactamase production in Cuban isolates

Introducción: Escherichia coli extraintestinal constituye uno de los principales patógenos causantes de infecciones asociadas a la asistencia sanitaria con un alto impacto en la salud por su morbilidad y mortalidad. Objetivo: Describir el comportamiento clínico de E. coli extraintestinal en hospitales cubanos, así como determinar la resistencia antimicrobiana y la producción de betalactamasas. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal, durante el período de mayo 2017 a junio 2018, en el Laboratorio Nacional de Referencia de Microbiología del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí que incluyó 119 aislados de Escherichia coli causantes de infecciones extraintestinales en 30 hospitales de diferentes áreas geográficas del país. Se llevó a cabo la identificación mediante el sistema API 20E y la determinación de la susceptibilidad in vitro a 16 antimicrobianos por el sistema automatizado VITEK-2 y el método de difusión por disco, excepto para la colistina que se empleó el método de elución de disco. Se realizó, además, la detección fenotípica de betalactamasa de espectro extendido, de tipo AmpC y metalobetalactamasa. Resultados: E. coli extraintestinal causó con mayor frecuencia infección de herida quirúrgica (23,5 por ciento), infección del torrente sanguíneo (20,7 por ciento), infecciones respiratorias (17,6 por ciento), infecciones de piel (16,8 por ciento) e infección del tracto urinario (12,6 por ciento). Predominó la resistencia a betalactámicos que osciló entre 61,3 por ciento y 89,1 por ciento, mientras que 79,8 por ciento y 80,5 por ciento de los aislados fueron resistentes a trimetoprim/sulfametoxazol y tetraciclina, respectivamente. La amikacina, la fosfomicina, la colistina y los carbapenémicos mostraron mayor actividad in vitro. El 43,7 por ciento produjo betalactamasas de espectro extendido, 7,6 por ciento AmpC plasmídica y 0,8 por ciento metalobetalactamasa. Conclusiones: La escasa sensibilidad en los aislados de E. coli extraintestinal a los antimicrobianos de primera línea, así como la detección de un aislado productor de metalobetalactamasa evidencia la necesidad de mantener un monitoreo continuo de este patógeno para el cual las alternativas de tratamiento son cada vez más restringidas(AU)

Introduction: Extraintestinal Escherichia coli is one of the main pathogens causing infections associated to health care, with a high impact on health, due to its morbidity and mortality. Objective: Describe the clinical behavior of extraintestinal E. coli in Cuban hospitals, and determine antimicrobial resistance and betalactamase production. Methods: A descriptive cross-sectional study was conducted at the Microbiology National Reference Laboratory of Pedro Kourí Tropical Medicine Institute from May 2017 to June 2018. The study included 119 Escherichia coli isolates causing extraintestinal infections in 30 hospitals from various geographic areas in the country. Identification was based on the API 20E system, and determination of in vitro susceptibility to 16 antimicrobials on the automated system VITEK-2 and the disk diffusion method, except for colistin, for which the disk elution method was used. Phenotypical detection was also performed of AmpC extended-spectrum betalactamase and metallobetalactamase. Results: The most common disorders caused by extraintestinal E. coli were surgical wound infection (23.5 percent), bloodstream infection (20.7 percent), respiratory infections (17.6 percent), skin infections (16.8 percent) and urinary tract infection (12.6 percent). A predominance was found of resistance to betalactams, which ranged between 61.3 percent y 89.1 percent, whereas 79.8 percent and 80.5 percent of the isolates were resistant to trimethoprim / sulfamethoxazole and tetracycline, respectively. Amikacin, fosfomycin, colistin and carbapenemics displayed greater in vitro activity. 43.7 percent produced extended spectrum betalactamases, 7.6 percent plasmid AmpC and 0.8 percent metallobetalactamase. Conclusions: The low sensitivity of extraintestinal E. coli isolates to first-line antimicrobials and the detection of a metallobetalactamase producing isolate are evidence of the need to maintain continuous surveillance of this pathogen, for which the treatment options are ever more restricted.

Actividad antimicrobiana de ceftolozano-tazobactam y ceftazidima-avibactam contra bacilos gramnegativos clínicamente relevantes aislados en México / Ceftolozane/tazobactam and ceftazidime/avibactam antimicrobial activity against clinically relevant gram-negative bacilli isolated in Mexico

Resumen Introducción: Existe poca información acerca de la efectividad de las combinaciones ceftolozano/tazobactam y ceftazidima/avibactam en cepas clínicamente relevantes aisladas en México. Objetivo: Determinar el perfil antimicrobiano de ambos antibióticos en nuestra comunidad. Método: El presente estudio de investigación fue prospectivo, descriptivo y transversal. Se incluyeron cepas clínicamente relevantes aisladas a partir de cultivos de cepa pura durante el periodo de agosto de 2018 a enero de 2019 en Mexicali, Baja California, México. Resultados: Se analizaron 74 cepas de enterobacterias y 19 cepas de Pseudomonas aeruginosa; el porcentaje de sensibilidad de ceftazidima/avibactam fue de 100 % contra enterobacterias y de 72.7 % contra Pseudomonas aeruginosa; el porcentaje de sensibilidad de ceftolozano/tazobactam fue de 90.5 % para enterobacterias y de 72.7 % para Pseudomonas aeruginosa. Conclusiones: Las combinaciones ceftolozano/tazobactam y ceftazidima/avibactam ofrecen buena sensibilidad antimicrobiana in vitro, tanto contra enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido como contra Pseudomonas aeruginosa. Se requieren más datos para valorar la respuesta clínica en pacientes que reciben esas combinaciones de antibióticos.

Abstract Introduction: There is limited information on the effectiveness of ceftolozane/tazobactam and ceftazidime/avibactam combinations on clinically relevant strains isolated in Mexico. Objective: To determine the antimicrobial profile of both antibiotic combinations in our community. Method: The present research study was prospective, descriptive and cross-sectional. Clinically relevant strains isolated from pure-strain cultures were included during the period from August 2018 to January 2019 in Mexicali, Baja California, Mexico. Results: 74 enterobacteriaceae and 19 Pseudomonas aeruginosa strains were analyzed; the percentage of sensitivity of ceftazidime/avibactam was 100 % for enterobacteriaceae and 72.7 % for Pseudomonas aeruginosa; the percentage of sensitivity of ceftolozane/tazobactam for enterobacteriaceae was 90.5 % and 72.7 % for Pseudomonas aeruginosa. Conclusions: The ceftolozane/tazobactam and ceftazidime/avibactam combinations offer good antimicrobial sensitivity in vitro, both for ESBL-producing enterobacteriaceae and Pseudomonas aeruginosa. More data are required to assess clinical response in patients receiving these antibiotic combinations.

Resistencia a la colistina en cepas de Klebsiella pneumoniae multidrogorresistente del período 2015-2018 en un instituto materno perinatal de Lima, Perú / Colistin resistance in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae strains at a perinatal maternal institute in Lima, Peru, 2015-2018

RESUMEN El objetivo del estudio fue evaluar los niveles y mecanismos de resistencia a la colistina y a los carbapenémicos en cepas de Klebsiella pneumoniae multidrogorresistente aisladas durante el periodo 2015-2018 en el Instituto Materno Perinatal de Lima. Se analizó la sensibilidad mediante difusión en disco y microdilución. La presencia de genes de resistencia a los carbapenémicos y a la colistina se determinó por reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) y se la relacionó con la clonalidad. Se analizaron 36 cepas de K. pneumoniae, cinco (13,8%) fueron resistentes a la colistina, pertenecían a diferentes grupos clonales. Se encontraron dos cepas con carbapenemasas (bla KPC y bla NDM) y no se detectaron genes plasmídicos para la colistina. Los niveles de resistencia al resto de antimicrobianos testados fueron elevados, a excepción de amikacina (13,9%). Los resultados destacan la presencia de cepas resistentes a la colistina (33,3% en 2018), situación preocupante por ser esta parte de las últimas alternativas de tratamiento para las infecciones causadas por patógenos multirresistentes.

ABSTRACT The objective of this study was to evaluate the presence of colistin- and carbapenemic-resistant genes in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated at the Instituto Materno Perinatal de Lima (2015-2018). Susceptibility levels were analyzed by disk diffusion and microdilution. The presence of colistin- and carbapenemic-resistant genes was determined by polymerase chain reaction (PCR) and was related to clonality. A total of 36 K. pneumoniae strains were analyzed, 5 (13.8%) were resistant to colistin and belonged to different clonal groups. Only 2 strains were found with carbapenemases (bla KPC and bla NDM), and no colistin plasmid genes were detected. High resistance levels to the other tested antimicrobials were observed, except for amikacin (13.9%). The results highlight the presence of colistin-resistant strains (33.3% in 2018), a worrying situation as they are part of the latest treatment alternatives for infections caused by multiresistant pathogens.